猎人试验篇（No.001-037）自鲸鱼岛出发（No.001） 主角小杰小时候因误入母狐熊的势力范围，就快要被攻击时，一名路过，名叫凯特的男子救了他。原来凯特是他的父亲──金的徒弟，来到鲸鱼岛的目的是为了要寻找线索，以完成金给的最终测试“找出他的行踪”。凯特告诉小杰许多关于他的父亲及猎人相关的事情，因此小杰对金及猎人这个职业有很大的憧憬。 不过，抚养小杰长大的米特阿姨并不希望他成为猎人，因此和他约定条件──钓到沼泽里的鱼精。而小杰也顺利完成，并拿到猎人试验的应考资格。 结识酷拉皮卡、雷欧力（No.002-004） 在去考试会场的船遇到了暴风雨，大部分的考生都晕船。船长看到此情形非常失望，不过却看到其中有三人神情泰然自若。结果，除了这三个人之外，其他人都搭小船到附近的岛屿去了。之后，船长聚集这三个人──小杰、酷拉皮卡和雷欧力，表示自己为猎人协会的雇员，并询问三人“考试的动机”。 酷拉皮卡说出自己的身世并表示成为猎人是为了复仇；而雷欧力表示他的动机是为了钱。对于雷欧力的回答，酷拉皮卡相当不屑，讥讽他“一个人的气质是用钱也买不到的”，雷欧力相当愤怒，对酷拉皮卡提出决斗。之后，因为小杰而休战。 直到猎人试验开始后，酷拉皮卡在途中了解到雷欧力对钱固执的理由，才完全的释然。之后和小杰三个人共同努力，以合格为目标。 结识奇犽、西索（No.005-037） 小杰在考试会场里，遇到了奇犽。意气相投又年龄相似的两人，与酷拉皮卡和雷欧力一起行动。 四人一路过关斩将来到最终试验，然而尼特罗会长设计了奇怪的淘汰赛。在对战者中，奇犽对上了自己的哥哥，遵从哥哥的话“不适合当猎人”，突然袭击雷欧力的对战者而丧失资格。 另一位在猎人试验中出众的考生西索，是以扑克牌为武器的角色，把小杰看作“青涩果实”，极度渴望在小杰成为足够强大的对手后杀死他，基于此理由，其曾在试验中协助小杰，对此小杰感到相当不甘心，也埋下天空斗技场篇的对战伏笔。 揍敌客家族篇（No.038-043）小杰、酷拉皮卡和雷欧力皆通过了猎人试验，为了带回奇犽，三人往奇犽的家出发。 暗杀家族揍敌客家是当地的观光名胜，三人顺利的来到奇犽家门口却无法进去，原来要进入揍敌客家必须打开沉重的“试炼之门”，否则就会被视为入侵者，被看门犬三毛咬死。后来在大门看守人皆卜戎的协助下，三人终于具备开门的能力，往本邸前进。 被囚禁在家的奇犽在得知小杰等人已来到家中，在与父亲长谈后便前往与其会合；虽然奇犽的母亲反对父亲这么做，但奇犽的父亲却意味深长的表示，奇犽总有一天会再回来。 在奇犽还未与三人会合的空档，揍敌客管家桐梧对三人进行“猜铜板”考验，并透过此考验给予小杰忠告，在桐梧最后一句“奇犽少爷就麻烦你们了。”之下，小杰一行人离开了揍敌客家。 四人再次团聚后，雷欧力为了准备医学院的考试而离开，而酷拉皮卡则展开寻找同族人眼睛“火红眼”与向幻影旅团复仇的旅程。小杰和奇犽则一起行动。 天空斗技场篇（No.044-063）小杰为了要再次与西索交手，便与奇犽一起去天空竞技场修练顺便赚钱。在那里，奇犽和同年的智喜对战，奇犽和小杰对智喜未知的力量感到疑惑，便前往询问智喜的师父云古，云古并未告知实情。 小杰和奇犽顺利的来到200楼，没想到在那里等着他们的竟然是西索。西索用神秘的力量妨碍他们进入200楼登记。云古知道之后便决定告诉他们实情，原来有条不成文的规定，也就是200楼的对战者都会使用“念”。云古协助他们开发“神秘的力量”──念能力。 西索对小杰提出如果能在200楼获得一胜，便与他战斗。急于战斗的小杰，不顾自己只学会一项基础，便与疾斗展开了念能力的战斗，小杰惨败，受了重伤，被云古禁止使用念能力2个月。 其间，西索与华石斗郎比赛，华石斗郎大败，西索却也因此负伤，弄断了两条手臂，同为旅团成员的玛奇为其治疗时，被玛奇训斥：“你是搞笑艺人吗？”。 另一方面，小杰则克制住了练习念的欲望，遵守了与云古的约定。 在云古的指导下，小杰和奇犽习得了念的基本，小杰也因此完成了猎人的秘密试验。 之后小杰和奇犽在疾斗及狸狈多的卑鄙手段下展开战斗，并获得胜利，小杰也因此达到与西索展开战斗的约定。虽然结果是西索轻松胜利，不过小杰也终于还了西索在试验时给予协助的人情，并离开天空斗技场。
返回鲸鱼岛篇（No.064-069）小杰与奇犽回到小杰生长的故乡──鲸鱼岛。而后米特阿姨把小杰父亲金·富力士所留下的小箱子交给小杰。小杰得到寻找金的新线索“贪婪之岛”。
友克鑫市篇（No.070-126）第五部分故事，主角四人再次在友克鑫市相遇。故事世界中最大规模的拍卖会在友克鑫市举行。 小杰、奇犽和雷欧力涌进各种方法筹集资金购买名称为“贪婪之岛”的游戏。“贪婪之岛”是在一种在称为“Joystation”的游戏机上运行的虚拟游戏，是金．富力士参与制作的游戏，在小杰眼中成为寻找寻找父亲线索的关键。而酷拉皮卡则是本篇的中心角色，由于在拍卖品中有“火红眼”，因此和同样想获得各种拍卖品的“幻影旅团”发生冲突。
贪婪之岛篇(GREED ISLAND/欲望岛)（No.126-185）在幻影旅团的团长库洛洛·鲁西鲁被酷拉皮卡的小指审判链限制住其行动后，小杰与奇犽再度踏上寻找金的旅程。这次他们打算进入由金与他的朋友们所创立的梦幻电玩游戏──贪婪之岛，寻找有关金所在之处的线索。在小杰的提议下，他们打算借由取得贪婪之岛拍卖的得主──首富“巴特拉”的认同而得以在不用取得贪婪之岛游戏软件的情形下直接进入游戏，但是却遭到巴特拉所雇用的猎人─绝兹绝拉的反对，两人因而开始进入“发”的修行来修练自己的专属必杀技，好取得绝兹绝拉的认同。 当他们取得认可并进入游戏之后，没过多久他们就见识到此游戏的危险之处──在此游戏里死亡的话就等同于真正的死亡，而这项设定也埋下了贪婪之岛游戏真面目的伏笔。而在之后与怪物们的战斗之中，更出现了一位神秘少女(比司吉)，表眀看不惯小杰与奇犽的战斗技巧而要求当他们的师父。同时，幻影旅团为了能使团长重返旅团，开始找寻世上仅存不到10个的除念师，好除掉团长身上的审判小指链使其可以再度领导旅团。过没多久，幻影旅团发觉到除念师很可能就在贪婪之岛游戏里的事实。 G·I过关条件是收集整000-099号指定卡片(共100张)。完成后可获得三张指定卡片带出游戏世界外。 G·I本身也是在现实世界之中，因此游戏里死亡的话就等同于真正的死亡。另外，如不依照正确途径(指不是通过贪婪之岛游戏软件进入)进入G·I，GM便会使用卡片排除入侵者。
嵌合蚁篇（No.186-）NGL篇（No.186-198） 小杰使用贪婪之岛破关得到卡片“同行”，打算去找金。但是在那里等着的并不是金，而是凯特。凯特他们在未确认生物的探索和调查中，发现嵌合蚁的残骸，一行人前往NGL。小杰和奇犽新冒险的开始 王诞生篇（No.199-） 小杰和奇犽了解嵌合蚁的强大，在凯特的牺牲生命下逃出NGL。在讨伐队还尚未准备完全之际，王诞生了。王率领直属护卫队和一部份士兵，在背后统治东果陀共和国，打算进行‘选别’(台湾版为"挑选")。为了防止更多的人死亡以及救凯特，小杰他们再次向嵌合蚁挑战。